NTFS tiene mejoras en cuanto al sitema de archivos FAT32 y Windows es mucho mas seguro y estable utilizando NTFS. Si quieres convertir la partición Fat32 a NTFS es posible hacerlo mediante una utilidad que posee Windows en consola, sin tener que formatear.
Inicio -> Ejecutar -> cmd una vez iniciada la consola tienes que teclear cd \ para ir a la raíz del disco.
Tecleas el siguiente comando: convert c: /fs:ntfs (siendo c: la letra de la unidad que quieras convertir).
Un mensaje te indicará que no puede realizar la conversión porque el disco está en uso.
Pulsa la tecla N y te preguntará si deseas que realice la conversión cuando vuelvas a iniciar el sistema. Ahora pulsa S y al reiniciar el PC la conversión del sistema de archivos se realizará.

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